Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rundc1Q0VDN7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rundc1Q0VDN7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms