Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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