Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2bQ0KL01 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms