Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnnm1Q0GA42 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnnm1Q0GA42 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms