Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cass4Q08EC4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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