Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MitfQ08874 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MitfQ08874 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms