Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pou6f1Q07916 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou6f1Q07916 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms