Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms