Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1bQ06985 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms