Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sox9Q04887 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sox9Q04887 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox9Q04887 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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