Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcad1Q04692 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms