Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfdn6Q03958 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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