Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scg2Q03517 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms