Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Crisp3Q03402 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms