Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddr1Q03146 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddr1Q03146 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms