Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb4Q02738 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb4Q02738 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb4Q02738 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gjb4Q02738 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms