Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col1a2Q01149 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col1a2Q01149 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms