Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms