Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrcdQ00LT2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms