Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbp4Q00724 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms