Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoa1Q00623 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms