Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cited1P97769 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms