Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas2P97460 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms