Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H3f3aP84244 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms