Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx3P81067 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx3P81067 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx3P81067 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx3P81067 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms