Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Ptprn2P80560 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Ptprn2P80560 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptprn2P80560 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ptprn2P80560 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptprn2P80560 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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