Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms