Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiitaP79621 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CiitaP79621 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms