Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tp53bp1P70399 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms