Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf6P70279 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf6P70279 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf6P70279 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms