Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga11P61622 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga11P61622 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga11P61622 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga11P61622 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms