Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr2iP60898 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms