Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Csrnp3P59055 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csrnp3P59055 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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