Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms