Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dpf3P58269 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms