Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms