Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox7bP56393 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms