Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rrp1P56183 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrp1P56183 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms