Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ephb3P54754 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms