Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnt2P50752 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms