Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TspoP50637 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TspoP50637 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms