Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pa2g4P50580 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms