Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SftpbP50405 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SftpbP50405 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SftpbP50405 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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