Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms