Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms