Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CitP49025 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CitP49025 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CitP49025 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CitP49025 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CitP49025 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CitP49025 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CitP49025 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CitP49025 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CitP49025 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms