Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms