Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf1P46099 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf1P46099 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf1P46099 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf1P46099 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf1P46099 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf1P46099 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf1P46099 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf1P46099 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms