Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin2aP35436 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin2aP35436 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms