Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms